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Chemotion Repository

Repositorium für Proben, Reaktionen und Forschungsdaten

Schnelle Fakten
  • Akzeptierte Datentypen:
    • MS: mzML, JCAMP-DX; Herstellerformate wie Thermo RAW werden akzeptiert und in Chemotion mit Proteowizard's msconvert nach mzML konvertiert.
    • NMR: Bruker-Format (als ZIP), JCAMP-DX.
    • IR und Raman: JCAMP-DX
    • XRD: JCAMP-DX,
    • UV-VIS: JCAMP-DX,
    • Zyklovoltammetrie: JCAMP-DX, Herstellerformate wie Gamry DTA, Metrohm CSV und TXT und PalmSens PSSESSION werden von ChemConverter akzeptiert und konvertiert.
  • Verwendete Standards/Ontologien: DataCite Metadata Schema, InChI, SMILES, molfile V2000 und V3000 CHMO Ontology, RXNO Ontology.
  • Bedingungen für die Ablage von Daten: offen
  • Empfohlen von Zeitschriften/Gesellschaften: Empfohlen von Angewandte Chemie und weiteren Wiley-Zeitschriften.

Chemotion Repository ist ein fachspezifisches Repositorium und umfasst Forschungsdaten, die Molekülen, deren Eigenschaften und Charakterisierung sowie Reaktionen und experimentellen Untersuchungen zugeordnet sind. Es wird am Karlsruher Institut für Technologie (KIT) betrieben. Forschende im Bereich der molekularen und synthetischen Chemie werden in ihrem Bemühen um einen FAIRen Umgang mit Daten unterstützt: Die Daten werden entsprechend der gängigen Praxis der Forschenden, die Molekülen und Reaktionen zugeordnet sind, gespeichert und das System stellt die erforderlichen Digital Object Identifier (DOIs) bereit. Die vorgegebenen Metadaten werden durch die Implementierung von Ontologiebegriffen unterstützt. Die Suchmöglichkeiten nach Text, Struktur und Identifikatoren sorgen für die Auffindbarkeit der Daten, und die eingereichten Proben und ihre Struktur werden in PubChem referenziert, um eine höhere Sichtbarkeit der Arbeit für die Forschenden zu erreichen. The Repositorium ist interoperabel mit dem Chemotion ELN, was bedeutet, dass die Daten ohne nennenswerte Hürden vom ELN zum Repositorium übertragen werden können. Die Daten werden durch automatische Kontrollen und einen Peer-Review-Prozess kuratiert. Die Einbindung der im Repository gespeicherten Daten in Publikationen wurde anhand mehrerer Beispiele gezeigt und wird derzeit von Chemistry-Methods empfohlen. Autoren können durch ihre ORCID iD referenziert werden. Chemiker und Materialwissenschaftler können Daten für den offenen Zugang (Datenansicht) und den registrierten Zugang (Datensatzbeitrag und Download) veröffentlichen. Die gespeicherten Daten können nach chemischer Struktur, Autor, Datensatztyp, Status, Identifikator und DOI durchsucht werden. Die aktuelle AAI-Lösung basiert auf einer internen Benutzerverwaltung (Administrator, anonymer und registrierter Benutzer, Kurator). Die Metadaten nach DataCite entsprechen dem Open Archives Initiative Protocol for Metadata Harvesting (OAI-PMH) Schema. Das Chemotion Repositorium bietet ein internes Stoffregister, einen Spektrenbetrachter (ChemSpectra), einen Struktureditor (Ketcher) und eigenen Datenkonverter.

Bitte beachten Sie: Das Chemotion Repositorium akzeptiert alle Datentypen und einige davon können in den Viewern verarbeitet und bearbeitet werden.

Hauptautoren: ORCID:0000-0001-9513-2468, ORCID:0000-0001-7696-7662, ORCID:0000-0003-4480-8661 and ORCID:0000-0002-5035-7978